[:no]K2-administrasjonen[:en]The administration at the Department of Clinical Science[:]

[:no]Her er link til en oppdatert side med informasjon om hvem som jobber i K2-administrasjone, og hvilken stilling de har. I tillegg har vi en mer detaljert oversikt her, under K2-nytt, der det er mulig å se hvilke oppgaver hver enkelt har, og hvem som kan hjelpe med hva.[:en]Here is a link to an updated page with information about who works in the department administration, and what position they hold. In addition, we have a more detailed overview here, where it is possible to see which tasks each has, and who can help with what.[:]

[:no]Nye publikasjoner[:en]New Publications[:]

[:no]Basert på siste ukes søk på “Department of Clinical Science AND Bergen”. Hvis du har publikasjoner som ikke favnes av dette søket, send referansen til elin.opheim@uib.no.

The cAMP-dependent protein kinase downregulates glucose-6-phosphatase expression through RORα and SRC-2 coactivator transcriptional activity.
Andre M, Jan-Inge B, Lise B, Gunnar M, Jørn SV.
Mol Cell Endocrinol. 2015 Oct 6. pii: S0303-7207(15)30104-0.

Prevalence of Cryptosporidium parvum/hominis, Entamoeba histolytica and Giardia lamblia among Young Children with and without Diarrhea in Dar es Salaam, Tanzania.
Tellevik MG, Moyo SJ, Blomberg B, Hjøllo T, Maselle SY, Langeland N, Hanevik K.
PLoS Negl Trop Dis. 2015 Oct 9;9(10):e0004125.

Biomarkers of Nutrition for Development-Folate Review.
Bailey LB, Stover PJ, McNulty H, Fenech MF, Gregory JF 3rd, Mills JL, Pfeiffer CM, Fazili Z, Zhang M, Ueland PM, Molloy AM, Caudill MA, Shane B, Berry RJ, Bailey RL, Hausman DB, Raghavan R, Raiten DJ.
J Nutr. 2015 Jul;145(7):1636S-1680S. Epub 2015 Jun 3.

Exploring the potential of public proteomics data.
Vaudel M, Verheggen K, Csordas A, Raeder H, Berven FS, Martens L, Vizcaíno JA, Barsnes H.
Proteomics. 2015 Oct 9.

Genetically-encoded tools for cAMP probing and modulation in living systems.
Paramonov VM, Mamaeva V, Sahlgren C, Rivero-Müller A.
Front Pharmacol. 2015 Sep 15;6:196.

 [:en]Based on last week’s search for “Department of Clinical Science AND Bergen”. If you have publications which are not covered by this search, send the reference to elin.opheim@uib.no.

The cAMP-dependent protein kinase downregulates glucose-6-phosphatase expression through RORα and SRC-2 coactivator transcriptional activity.
Andre M, Jan-Inge B, Lise B, Gunnar M, Jørn SV.
Mol Cell Endocrinol. 2015 Oct 6. pii: S0303-7207(15)30104-0.

Prevalence of Cryptosporidium parvum/hominis, Entamoeba histolytica and Giardia lamblia among Young Children with and without Diarrhea in Dar es Salaam, Tanzania.
Tellevik MG, Moyo SJ, Blomberg B, Hjøllo T, Maselle SY, Langeland N, Hanevik K.
PLoS Negl Trop Dis. 2015 Oct 9;9(10):e0004125.

Biomarkers of Nutrition for Development-Folate Review.
Bailey LB, Stover PJ, McNulty H, Fenech MF, Gregory JF 3rd, Mills JL, Pfeiffer CM, Fazili Z, Zhang M, Ueland PM, Molloy AM, Caudill MA, Shane B, Berry RJ, Bailey RL, Hausman DB, Raghavan R, Raiten DJ.
J Nutr. 2015 Jul;145(7):1636S-1680S. Epub 2015 Jun 3.

Exploring the potential of public proteomics data.
Vaudel M, Verheggen K, Csordas A, Raeder H, Berven FS, Martens L, Vizcaíno JA, Barsnes H.
Proteomics. 2015 Oct 9.

Genetically-encoded tools for cAMP probing and modulation in living systems.
Paramonov VM, Mamaeva V, Sahlgren C, Rivero-Müller A.
Front Pharmacol. 2015 Sep 15;6:196.

 [:]

[:no]Kjernefasiliteter ved klinisk institutt 2[:en]Core Facilities at Department of Clinical Science[:]

[:no]Roland Jonsson

En kjernefasilitet er en samling av vitenskapelig utstyr og høyt kvalifisert teknisk personale som gjøres allment tilgjengelig for forskningsmiljøene. De tre nåværende kjernefasilitetene ved klinisk institutt 2: Flow Cytometry Core Facility, Genomics Core Facility and Metabolomics Core Facility, dekker viktige fellesfunksjoner ved MOF og UiB så vel som regionalt og nasjonalt. De er tilgjengelige for alle akademiske brukere på samme gunstige vilkår og for kommersielle brukere på UiBs vilkår for oppdragsforskning.

Instituttet forvalter fakultetets policy angående deling av kostnader og medforfatterskap ved bruk av fakultetets kjernefasiliteter. Denne policyen innebærer at alle UoH-forskere i Norge, Helseforetakene inklusive, får tilgang på like vilkår, også prismessig. Mer om dette se: http://www.uib.no/mofa/67221/kostnadsdeling-og-medforfatterskap

Økonomien i alle kjernefasiliteter skal delvis sikres gjennom egenbetaling, og gjennom driftsmodeller som ivaretar behovet for reinvestering og utstyrsfornyelse.

For at kjernefasilitetene skal kunne yte best mulig service til miljøene er det et mål at de er tett integrert med forskere som er ledende innen sine fagfelt. Bruk av kjernefasiliteter skal dermed være et mer attraktivt alternativ enn å kjøpe eget utstyr og lønne eget teknisk personale, både kostnadsmessig og metodisk. Erfaring tilsier at kjernefasiliteter er den beste og mest realistiske måten for å gi forskningsmiljøene i Norge tilgang til en oppdatert og vedlikeholdt instrumentpark, og til metodisk kunnskap de selv ikke har og utstyr og personale de ikke ville hatt råd til.

Måten kjernefasilitetene ved MOF driftes på er basert på erfaringene fra NFRs FUGE-satsning. Kjernefasilitetene driftes og finansieres av Instituttet/MOF i samarbeid med UiB, Helse Bergen, Helse Vest, Det matematisk-naturvitenskapelige fakultet, Bergen Forskningsstiftelse, NFR, samt enkeltgrupper av forskere.

Viktig å tenke på – Dersom bruken av en kjernefasilitet utgjør deler av grunnlaget for en vitenskapelig publikasjon skal kjernefasiliteten nevnes i acknowledgement-delen av publikasjonen, for eksempel: «Parts of the work was carried out at the NAME OF CORE FACILITY and was thus supported by the Faculty of Medicine and Dentistry at the University of Bergen and its partners”.

To nye flotte tilskudd som spesielt bør oppmerksammes er: CyTOF – Mass cytometry med enkelt-celle proteomikk muligheter  – til Flow (utstyret levert og er under utprøving), og NFR-infrastrukturmidler til utstyr for human helgenomsekvensering til Genomics.

Roland[:en]Roland Jonsson

A core facility is a collection of scientific equipment and highly qualified technical staff made widely available to the research community. The three current core facilities at the Department of Clinical Science: Flow Cytometry Core Facility, Genomics Core Facility and Metabolomics Core Facility, cover important common functions by MOF and UiB as well as regionally and nationally. They are available to all academic users on the same favorable terms and for commercial users of the University’s conditions for contract research.

The department administers the Faculty’s policy regarding sharing of costs and co-authorship when faculty core facilities are used. This policy means that all higher education researchers in Norway, health trusts included, gain access on equal terms, including the same price. More on this see: http://www.uib.no/mofa/67221/kostnadsdeling-og-medforfatterskap (in Norwegian).

The economy of all core facilities will be partially secured through user fees, and through operating models which address the need for reinvestment and equipment renewal.

To ensure that the core facilities are able to provide the best possible service to the communities it is a goal that they are tightly integrated with scientists who are leaders in their fields. Use of core facilities should thus be a more attractive option than buying your own equipment and pay own technical staff, both cost-wise and methodical. Experience has shown that core facilities are the best way to give researchers in Norway access to an updated and maintained instrument park, and to the methodological knowledge they do not have themselves and equipment and staff they could not afford.

The way the core facilities at MOF are operated is based on experiences from the NRC FUGE initiative. The core facilities are operated and financed by the Department / MOF in cooperation with the University of Bergen, Helse Bergen, Helse Vest, the Faculty of Science, Bergen Research Foundation, NRC, and individual groups of researchers.

Important to remember – If the use of a core facility forms part of the basis for a scientific publication the core facility should be mentioned in the acknowledgment section of the publication, for example: «Parts of the work was carried out at the NAME OF CORE FACILITY and was thus supported by the Faculty of Medicine and Dentistry at the University of Bergen and its partners «.

Two great new additions to be especially mentioned are: CyTOF – Mass cytometry with single-cell proteomic opportunities – for Flow (equipment has been delivered and is being tested), and NRC infrastructure funds for equipment for complete human genome sequencing to Genomics.

Roland[:]