Til alle ansatte.

Det nærmer seg tiden for UiBs store nasjonale bærekraftskonferanse 6. og 7.
februar. Som i fjor holder vi en arrangementsdag den 5. februar som vi kaller
Day Zero. Her finnes det noe for enhver smak, og godt faglig påfyll.

Du kan delta på en rekke svært interessante seminarer og workshops med ulike
tilnærminger til bærekraft. Har du studenter i undervisning kan kanskje noen av
arrangementene være relevant å ta med studentene på. Day Zero er selvfølgelig
gratis og et virkelig unikt tilbud.

Det er mer enn 30 arrangement å velge mellom, og temaene spenner bredt. Ta en
titt på listen her.

Med vennlig hilsen,

Ingrid Hagerup

Nytt år betyr ny søknadsrunde til Norges forskningsråd som i år har frist 6. mai. Det er ikke kommet ut noe informasjon men mest sannsynlig vil en ha mulighet til å søke på helseprogrammene BEHANDLING, BEDREHELSE og HELSEVEL og programmet FRIPRO som er åpent for alle tematiske områder. Innen FRIPRO kan en søke om forskerprosjekt, mobilitetsstipend og unge talenter. Mobilitetsstipend og unge talenter er rettet mot forskere på et tidlig stadium i karrieren, 2-7 år etter disputas med mulighet for å trekke fra tid for permisjoner, etc.

Det går rykter om at det neste fellesløftet (Toppforsk) også vil ha frist 6.mai. Dette er et program for å utvikle sterke forskningsmiljøer til å bli internasjonalt ledende innenfor sine fagfelt. Ingenting er bekreftet men svar gjerne i spørreskjemaet (lenke under) om dette programmet er av interesse så tar vi kontakt når vi får mer informasjon.

Instituttet vil gjerne vite hvem som planlegger å søke i år for å kunne planlegge administrative ressurser. Vi ber de som planlegger å søke om å fylle inn skjemaet innen 31.januar, det tar 2 min:

https://skjemaker.app.uib.no/view.php?id=7844053

Du inviteres herved til kræsjkurs i Design Thinking, fredag 24.januar 0900-1600 på Marineholmen Makerspace.

Design Thinking er hovedverktøy for innovasjon, fokusert på brukerbehov og rask testing av praktiske løsninger. Seminaret med Federico Lozano er svært høy kvalitet, nyttig for alle fagområder, og ikke minst veldig gøy! NB: svært begrenset antall plasser, påmelding kun via link.

The Respiratory Research group is organising the workshop

Bioinformatic analysis of the airway microbiome: A QIIME2 workshop

16th – 20th of March 2020

This five-day workshop focuses on applied bioinformatics in the field of microbiome data mainly for non-computer scientists using QIIME2. The QIIME2 developers Greg Caporaso and Matthew Ryan Dillon will teach at the workshop.

Participants are required to have some experience with QIIME2 prior to attending the workshop, as no introduction to QIIME2 will be given. Examples used in the workshop will be from the MicroCOPD study, which is data consisting of 16S-rRNA (bacterial) and ITS (fungal) sequencing data from lung samples. Since these samples are low biomass, an emphasis will be on the challenges related to contamination in microbiome analysis.

Participants can bring their own data, but workshop datasets will also be provided. The sessions in the workshop include interactive discussions on several related topics such as different denoising strategies, bioinformatic identification and handling of contaminants, filtering strategies, diversity analyses, differential abundance testing, statistics interpretation, and visualisation and presentation of data.

The spaces are limited, and priority will be given to applicants with relevant background. If you are interested in attending the course, check out the information here:

https://www.digitallifenorway.org/arrangementer/bioinformatic-analysis-of-the-airway-microbiome-a-qiime2-workshop

Dette er en påminnelse om innsending av forskerlinjeprosjekt.

PROSJEKTER BES SENDT PÅ EPOST TIL marianne.stien@uib.no.

Les videre →

CamBioScience are organising courses and conferences that might be of interest. Courses include: Data Analysis, CRISPR and Organoids. More information about each course can be found on their website.

Use the promo code DEP05MW0709 during registration to get a 5% discount.

Priyanthi Borgen Gjerde will defend her PhD thesis on Wednesday 29th January 2020

Trial lecture: Wednesday 29th January 2020 at 09.15.
Topic: “Lipid metabolism in physical health promotion and follow up of treatment response in psychotic disorders”
Place:Auditorium, Armauer Hansens hus, Haukelandsveien 28

Public defense: Wednesday 29th January 2020 at 11.15.
Title of dissertation: “Lipid effects during antipsychotic drug treatment and their relevance for clinical outcomes”
Place: Auditorium, Armauer Hansens hus, Haukelandsveien 28

1st opponent: professor Olli Kampman, Universitetet i Tampere, Finland
2nd opponent: førsteamanuensis Eva Malt, Universitetet i Oslo
3rd member of the comittee: professor II Jørn V. Sagen, Universitetet i Bergen

The defense will be led by professor Francisco Gomez Real

Kan du fortelle litt om arbeidet ditt? Hva er de konkrete arbeidsoppgavene dine?
Jeg er ansatt i 100% stilling som professor ved Klinisk institutt 2, så hovedjobben min er jo i prinsippet todelt, å drive med forskning og med undervisning av medisinstudentene.
Forskningsmessig så har jeg i alle de år arbeidet hovedsakelig med dyreeksperimentell forskning med fokus på hjertefunksjon og sirkulasjon. Jobben innebærer å være både tilrettelegger, forskningsveileder samt prosjektmedarbeider i pågående doktorgradsprosjekter og forskergrupper.

For tiden er jeg involvert i flere dyreeksperimentelle studier på griser i full narkose. I disse dyremodellene kan vi simulerer åpne hjerteoperasjoner, livstruende sviktende hjertefunksjon og hjertestans. Mange av studiene handler om bruk av mekanisk sirkulasjonsstøtte med forskjellig typer utstyr (hjerte-lungemaskin, ECMO og Impella-pumper) som midlertidig kan understøtte eller erstatte hjertefunksjonen. Dette utstyret brukes også på pasienter, og vi ønsker i våre dyreeksperimenter å studere hvordan vi kan optimalisere hjertefunksjonen og sirkulasjonen til hjertemuskelen under og etter denne typen behandling. Det blir ofte lange dager i Vivarium med forsøk som kan vare i 8-10 timer. Der disponerer vi en god del avansert registreringsutstyr for vurdering av hjertefunksjon og sirkulasjon. Så går det jo mye tid til å samle, systematisere og analysere data fra slike forsøk. I samarbeid med doktorgradskandidater og andre utarbeides det så manuskripter med tanke på publikasjon.

Siden jeg opp gjennom årene har samarbeidet mest med hjertekirurgene ved Haukeland Universitetssykehus når det gjelder forskningen, har det blitt naturlig at jeg har en del undervisning for medisinstudentene om tema som omhandler hjerte- og thoraxkirurgisk behandling. Både rene forelesninger og pasient-nær undervisning på Hjerte Post 4 er noe av det jeg driver med. Jeg er jo dessuten involvert i nye eksamensordninger (OSKE) og i den faglige planleggingen av undervisningen i fagområdet Sirkulasjon. Siden jeg har muligheten her i K2Nytt; jeg og mange med meg synes at det er avsatt alt for liten tid og ressurser til undervisning både i hjertesykdommer generelt og i hjerte-thoraxkirurgi spesielt i den nye studieplanen MED2015. Her må det gjøres noen endringer.

Hva liker du å arbeide med på K2?
Det er vel det å arbeide sammen med andre mot noen felles mål både hva gjelder å få til god forskning og god studentundervisning som er det viktigste og som jeg liker best med jobben. I mitt tilfelle så kan det være å samarbeide med forskere, teknikere og administrative både fra K2, fra K1, fra Haukeland Universitetssykehus og andre. I tillegg så er det jo mange hyggelige kollegaer og medarbeidere som en treffer på og omgås med i hverdagen på K2.